Гомологичная рекомбинация (ГР) является сложным механизмом, выполняющим множество функций в живом организме.
четверг, 31 августа 2017 г.
воскресенье, 27 августа 2017 г.
ДНК импорт и экспорт
Поговорим в деталях о каждой из систем молекулярной генетической инженерии, перечисленных в предыдущем разделе. Остановимся сегодня на ДНК импорте и экспорте.
пятница, 18 августа 2017 г.
Молекулярные механизмы естественной генной инженерии
За последние 60 лет молекула ДНК показала себя как необычайно сложный
и податливый носитель информации. Практически каждая клетка обладает
стандартным набором биохимических инструментов для изменения ДНК —
белки, которые режут, расплетают, наращивают, осуществляют отжиг
(соединение комплементарных цепей) и сплайсинг (соединение концами)
цепей ДНК. Самые общие операции по модификации ДНК самими клетками,
которые были показаны экспериментально, указывают на то, что любая
реорганизация возможна до тех пор, пока конечный продукт
соответствует всем правилам построения молекулы ДНК.
воскресенье, 13 августа 2017 г.
Различные классы молекул ДНК в геноме
Когда мы обсуждали форматирование генома, мы рассматривали различные
классы последовательностей ДНК и РНК: кодирующие, некодирующие (не
кодируют белки, но полны информационного содержания) и различного рода
форматирующие последовательности. В биоинформатике существует задача
аннотации и каталогизирования, на основе которых можно
классифицировать нуклеиновые последовательности.
воскресенье, 16 июля 2017 г.
Форматирование генома при делении и репликации
Для эффективного выполнения функции наследования в делящихся клетках
молекулы ДНК должны своевременно и с высокой точностью переходить в
дочерние клетки. Мы уже обсуждали ранее точки контроля клеточного
цикла. Однако, как и в случае с транскрипционной регуляцией, ДНК
молекулы также должны быть форматированы определенными сигналами для
осуществления полноценной репликации, локализации в каждой отдельной
фазе клеточного цикла и точной передачи в дочерние клетки. Существует
несколько отдельных типов сигналов форматирования.
воскресенье, 2 июля 2017 г.
Упаковка хроматина
В прошлый раз мы узнали о двух направлениях мысли, повлиявших на наше
понимание не-генетического наследования. Первое из них составляли
умозрительные ("ландшафт Уодингтона") и экспериментальные
(генетический импринтинг, парамутации) попытки в области клеточной
дифференциации и наследственности. Вторая линия мысли, приведшая к
нынешнему пониманию эпигенетики, находилась в обширной области
исследований упаковки ДНК и ее связи с репликацией и транскрипцией.
суббота, 27 мая 2017 г.
Эпигенетическая регуляция
В конце 20го века еще представлялось возможным полагать, что
регуляторные сети достаточно сложны, чтобы управлять доступом к
кодирующим последовательностям генома [1]. Однако, вскоре два
независимых пути размышления и эксперимента обнаружили дополнительные уровни более высокого порядка для контроля генной экспрессии. Эти два пути, хотя и независимые вначале, слились воедино и начертали удивительно стройную картину. Такой многоуровневый подход обогащает наше понимание функционирования генома, а также позволил нам учитывать временную шкалу эволюционного изменения непредвиденным образом [2].